A Diretoria de Pesquisa é o órgão da PROPP encarregado de acompanhar a gestão da política institucional de pesquisa na UFU. 

Cabe a DIRPE em linhas gerais:

• Assessorar o pró-reitor no planejamento das diretrizes políticas de pesquisa;
• Fazer a interface entre a UFU e as agências de fomento (nacionais e estrangeiras), como forma de viabilizar a captação de recursos para financiamento da pesquisa e da pós-graduação;
• Elaborar e executar o orçamento institucional destinado à pesquisa;
• Coordenar a participação da UFU em eventos científicos de caráter regional e nacional, no âmbito da PROPP;
• Executar e operacionalizar a gestão dos programas institucionais de iniciação científica (PIBIC/PIVIC UFU, CNPq e FAPEMIG; PIBIC EM e PIBIC JR);
• Executar e operacionalizar a gestão dos programas especiais de apoio à pesquisa ;
• Assessorar as diversas instâncias da UFU no planejamento e na formulação da política institucional de cooperação acadêmica internacional;
• Executar, operacionalizar e auxiliar a participação da UFU nos programas de intercâmbio acadêmico internacional;
• Fazer a gestão dos programas, acordos e convênios de cooperação acadêmica internacional de que a UFU seja signatária;
• Administrar o Sistema SG (Sistema de Gestão);
• Buscar fontes alternativas de recursos para a pesquisa, ampliar a divulgação das oportunidades em pesquisa, bem como prêmios direcionados a alunos e professores;
• Incentivar a participação dos pesquisadores da UFU, em todos os seus Campi, nas iniciativas nacionais e internacionais relacionadas às atividades fins, estimulando parcerias de pesquisa interinstitucionais, universidade x setor empresarial e projetos de P&D setoriais, tendo como principal foco atender as chamadas publicas publicadas pela Financiadora de Estudos e Projetos (FINEP) uma empresa pública vinculada ao Ministério de Ciência Tecnologia e Inovação (MCTI);